¿Cuáles son las propiedades físicas y químicas de la enfermedad por viroide enano del lúpulo?
Nombre del viroide: Hopstuntviroid (HSVd).
Estado de clasificación: los viroides enanos del lúpulo pertenecen al género Hostuviroid, subfamilia de viroides del tubérculo fusiforme de la patata Pospiviroinae, familia de viroides del tubérculo fusiforme de la patata Pospiviroidae. El código del Comité Internacional de Taxonomía de Virus (ICTV) es 80.001.0.02.001.
Sinónimos de viroides: Grapevineviroid (Shikata et al., 1984); Cucumberpalefruitviroid (descubierto desde 1965).
Purificación de viroides: Hojas enfermas de pepino congeladas, añadir 1,5 volúmenes de 1mol/LK2HPO4 (que contiene 1SDS, 0,1 volúmenes de bentonita y 0,2 volúmenes de mezcla fenol-cloroformo), triturar, centrifugar, retener la fase acuosa, añadir Nucleic Los ácidos se precipitaron con etanol al 70%. Trate la preparación de ácido nucleico con 1 volumen de 2-metoxietanol, bromuro de 2cetiltrimetilamonio, 2 mol/l de cloruro de litio y 25 g/ml de ADNasa IDNasaI. Agregue tampón de ácido nucleico (que contenga 35 etanol), inyéctelo en la columna de celulosa CF-11 y utilice el mismo. tampón para pasar a través de la columna, luego usar tampón sin etanol para eluir el viroide, mezclar varias fracciones de bajo peso molecular y pasar a través de poliacrilamida en condiciones sin cambios. Purificar por electroforesis (7,5, 10, 12,5 o 20 gel), cortar el. banda específica de viroide enano del lúpulo, remojar y eluir el gel, extraer el ARN del viroide y, si es necesario, purificarlo en condiciones desnaturalizantes (7 ~ 8 mol/l de urea) para una purificación adicional. Se pueden obtener aproximadamente de 20 a 40 μg de viroide enano del lúpulo (Yoshikawaamp; Takahashi, 1982) por kilogramo de hojas de pepino enfermas.
Propiedades físicas y químicas de los viroides: La cepa de lúpulo es un ARN monocatenario cerrado monovalente que contiene 297 nucleótidos (Ohno et al., 1983), y su secuencia de nucleótidos de longitud completa ha sido clarificada ( Ohno et al., 1983) La cepa de uva (4 cepas) y la cepa de pepino están compuestas por 297 y 303 nucleótidos respectivamente. La diferencia con la cepa de lúpulo es que tienen 1 y 16 sustituciones de nucleótidos (Sano et al., 1983). 1986).
Cepas de viroides: el rango de huéspedes y los síntomas del viroide enano del lúpulo son similares a los del viroide enano de la uva y al viroide del ginkgo del pepino (VanDorstamp; Peters, 1974; Sasakiamp; Shikata, 1977; Sanoe et al., 1985). ), aunque las secuencias de nucleótidos de los tres tipos de virus son ligeramente diferentes, la identidad es extremadamente alta, llegando a 95 a 99 (Sano et al., 1984). En el campo no se encontraron aislamientos con síntomas diferentes en cepas de lúpulo. La sonda oligonucleotídica sintetizada (5'GGTAAGTACCTCCCT3' es complementaria a los residuos 51-65 de la cepa de uva) se puede utilizar para distinguir las tres cepas en la prueba de hibridación puntual (T.Sano et al., 1988).
Otros: viroide enano del lúpulo y otros 7 tipos de virus (viroide de las manchas solares del aguacate, viroide enano del crisantemo, viroide de la piel agrietada de los cítricos, viroide de la muerte del coco, viroide del tubérculo fusiforme de la patata, viroide apical del tomate y viroide de cepa masculina del tomate) , incluido el rango de huéspedes, los síntomas, el tamaño molecular, la movilidad electroforética en geles de poliacrilamida y la secuencia de nucleótidos. El viroide enano del lúpulo infecta principalmente el lúpulo y algunas plantas cucurbitáceas (como los pepinos) y muestra síntomas, mientras que infecta algunas plantas de la familia Solanaceae (como los tomates) de forma asintomática, en cambio, el viroide del tubérculo fusiforme de la patata infecta principalmente algunas plantas de la familia Solanaceae; (como los tomates) Algunas plantas (como los tomates) producen síntomas y algunas plantas de Asteraceae (como Panax notoginseng) se infectan de forma asintomática, pero las plantas de Cucurbitaceae no están infectadas.
La cepa de lúpulo y la cepa de uva del viroide enano del lúpulo tienen 297 nucleótidos, mientras que la cepa del pepino tiene 303 nucleótidos, que es aproximadamente de 40 a 70 nucleótidos menos que el viroide del tubérculo ahusado de la patata. La identidad de secuencia de nucleótidos entre los viroides y el tubérculo ahusado de la patata. viroides es sólo 55 (Ohno et al., 1983).
En las plantaciones de lúpulo japonesas, la gama de huéspedes herbáceos del viroide enano del lúpulo se limita a plantas de las familias Cucurbitaceae y Solanaceae, sin huéspedes de otras familias (Yaguchiamp; Takahashi, 1984), uvas y lúpulo en Japón. Las áreas de plantación son las mismas y hay más de 80 cepas de uva infectadas (Sano et al., 1986, por lo que se especula que los viroides del lúpulo pueden provenir de la uva). Recientemente se descubrió un viroide similar en cidra, ciruela y melocotón japoneses (Sano et al., 1986). Los viroides enanos del lúpulo y varios viroides estrechamente relacionados pueden distribuirse por todo el mundo.