La guerra civil de Li Zhen se hizo famosa
Tras la victoria de la Guerra Antijaponesa en septiembre de 1945, fue ascendido a comandante del 65º Ejército del Ejército Nacional Revolucionario. En 1946, el cuartel general se reorganizó en la 65.ª División (65.º Ejército) y él se desempeñó como comandante de la división. Bajo el mando de Li Mo'an del Primer Distrito de Apaciguamiento, durante las siete batallas y siete victorias de Su Yu en Suzhong, su 187.a Brigada fue aniquilada en la batalla para liberar a Huangqiao. Esto lo sorprendió mucho, por lo que se quedó con cautela en Hai. 'an y finalmente esperó. Cuando llegaron refuerzos, atacó el área de la base de Shandong el año siguiente y ocupó Mengyin. Ye Fei y Tao Yong también levantaron el asedio de las tropas de Yang Gancai del 20.º Ejército del Ejército de Sichuan en el condado de Teng. Más tarde, corrieron en ayuda de Xinyang y, bajo el mando de Cheng Qian, director del campamento de Wuhan, sitiaron la zona de la base de la montaña Dabie. En marzo de 1948, el regimiento de Liu Kan fue destruido en la Batalla de Yiwa. Se le ordenó reforzar y cooperar con el Departamento de Ma Jiyuan para cortar la retirada de Peng Dehuai varias veces (esta batalla fue llamada la Victoria del Valle Jingwei por el Kuomintang y Xifu por. la Batalla del Partido Comunista) Durante la Batalla de Xifu en Longdong, la 65.a División reorganizada y Ma Jiajun llegaron al mismo tiempo. Ambos pensaron que la otra parte era Tubal Road, por lo que pelearon entre sí y luego sintieron que algo andaba mal. Hubo un fuego de artillería tan feroz por parte del Partido Comunista, y Ma Jiajun capturó a 65. Tomaron prisioneros en el ejército, pero resultó que hablaban como gallinas y patos y nadie podía entender el dialecto del otro. Fueron lo suficientemente inteligentes como para sacar un bolígrafo para escribir y comunicarse, y finalmente se dieron por vencidos. En la posterior Batalla de Libei, bajo sus estrictas órdenes, participó en una guerra móvil con el Partido Comunista. Después de una sangrienta batalla, hizo retroceder al ejército japonés. Hu Zongnan estaba encantado y quería ascenderlo a comandante del 18.º Cuerpo. Tenía miedo de que Hu Zongnan pretendiera ser el comandante del 65.º Ejército, de vida o muerte.
El Cuerpo se formó en noviembre de 1948 a partir del 1.º Ejército del Ejército Nacional Revolucionario, el 38.º Ejército del Ejército Nacional Revolucionario y el 65.º Ejército del Ejército Nacional Revolucionario, con Li Zhen como comandante y Brigada Chen Ju como subcomandante. En mayo de 1949, el 90º Ejército del Ejército Nacional Revolucionario fue transferido al Cuerpo. El 25 de noviembre, todo el 65.º Ejército del 18.º Cuerpo, la 61.ª División del 90.º Ejército y la primera sección del 30.º Ejército del Ejército Nacional Revolucionario anunciaron el Levantamiento del Este de Sichuan.
Participó en la Campaña de Primavera del Noroeste, la Campaña de Shaanxi Central, la Campaña Fumei, la Campaña de Long-Shaanxi y la Campaña del Suroeste. Después de que Hu Zongnan se retirara de Xi'an en 1949, él y el regimiento de Pei Changhui permanecieron en la orilla norte del río Weishui para una defensa móvil. Después de que el Ejército Popular de Liberación lanzó la Batalla de Fumei, rápidamente estalló en un cerco. Según él, las tropas no perdieron mucho, incluso armas pesadas.
Cuando el Yuan Ejecutivo celebró una reunión de emergencia, Chiang Kai-shek en el edificio Huangpu estaba convocando a Li Zhen, comandante del 18.º Cuerpo del Kuomintang, que acababa de retirarse del sur de Shaanxi y del norte de Sichuan hacia el Área de Chengdú. Este regimiento es una de las fuerzas principales en el sur de Hu Zong. Su llegada a la zona de Mianyang, cerca de Chengdu, es evidentemente una buena noticia para Chiang Kai-shek, que teme no tener tropas disponibles. Chiang Ching-kuo también registró felizmente en su diario ese día: "En ese momento, las tropas de Hu Zongnan habían cruzado las montañas Qinling y habían viajado una gran distancia hasta la llanura de Chengdu. Se enfrentaron al enemigo durante 600 kilómetros y alcanzaron una distancia de más de 1.000 kilómetros. El destino en realidad se completó rápidamente en medio mes sin ninguna pérdida de fuerza principal, lo que también es un milagro en la derrota."